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財政部變更薪資所得扣繳原則，不管固定或非固定薪資，改在月底合併算總帳。選擇依扣繳稅額表扣稅，且經常有不定期獎金、補助費等收入的民眾，全月扣繳稅款可能不降反升，可支配收入會減少。


不過，扣繳稅款屬暫付性質的稅捐，可在每年5月申報所得稅時，扣除實際應納所得稅負。因此，當預扣稅款總額超過全年實際應納稅款者，可坐等退稅；反之，則要補稅。


財政部調整薪資扣繳原則後，屬於3月7日以後給付的所得，應合併按「全月給付總額」一起扣稅。民眾可選擇依薪資扣繳稅額表「查表」扣稅，也可直接按6%稅率按月扣繳。查表扣稅一般較能反映實質稅負，避免退補稅的麻煩，但在新扣繳方式下，每月扣繳稅捐反而比較容易上升。


以薪資扣繳稅額表中單身無扶養親屬者為例，起扣額為54,501元，按月扣繳2,030元，低於5.45萬元者免扣所得稅。全月所得每增加500元，扣繳稅款約上升60到70元；選擇按6%稅率扣繳者，所得逾2,000元，也免預扣所得稅。


新規定之下，企業激勵員工加發的績效獎金，或提供員工福利發放如婚喪補助費、旅遊補助金等非固定性薪資，已喪失2,000元內免扣稅權利。3月7日起，小額獎金、補助費都要合併固定薪資一道扣繳所得稅。


非固定薪資與固定薪資合併扣稅結果，民眾每月薪資扣繳稅款將出現不確定性。非固定薪資筆數愈多、且金額多數在2,000元以下者，將因合併固定薪資計算扣繳稅款因素，導致全月扣繳稅款向上推升。


以單身無扶養親屬者為例，若月薪為5.45萬元，原本不必扣稅，但當月若出現一筆500元獎金等非固定收入時，全月給付薪資總額即跨過起扣額達到5.5萬元，扣繳稅款會從零變成2,030元，實領金額降為52,970元，全月可支配所得反而變少。